ĐHQGHN luôn chủ trương ưu tiên phát triển hợp tác lâu dài, tin cậy với các đại học, các tổ chức khoa học và giáo dục có uy tín trên thế giới, với các tập đoàn, doanh nghiệp ngoài nước dưới hình thức hợp tác nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ, liên kết đào tạo quốc tế chương trình đại học và sau đại học, tổ chức hội thảo khoa học quốc tế, trao đổi sinh viên, giảng viên và cán bộ, ...

Khẳng định vị thế thông qua các chương trình hợp tác nghiên cứu lớn: Dự án VIBE; Dự án châu Âu về “Nghiên cứu lịch sử và số hóa tư liệu văn bia Việt Nam”; Dự án "Hệ thống nước bền vững áp dụng công nghệ 4.0 nhằm xây dựng các cộng đồng bền vững tại đồng bằng Sông Hồng và Phú Yên”; Dự án do UNDP tài trợ về “Xây dựng năng lực nghiên cứu chính sách, giáo dục và đào tạo nhằm thúc đẩy phát triển xanh”; Dự án ODA với Nhật Bản về “Phát triển nghiên cứu và đào tạo tại chỗ về khoa học phân tích nhằm tăng cường nguồn nhân lực phục vụ kiểm soát an toàn thực phẩm và chất lượng môi trường ở Việt Nam”; 03 dự án FIRST; các chương trình ERASMUS + với Tây Ban Nha, Đức, Áo, Rumani và Italy …